此后，东岳在科技创新方面屡建奇功。2001年5月，东岳开始启动了单体装置为3000吨的聚四氟乙烯（PTFE）项目。PTFE又称为“塑料王”，具有使用温度广泛、化学性高、自润滑性好、绝缘性能优良、不燃、防粘、抗污、耐老化等特性，在航天、核工业、电子、机械、化工、纺织、建筑、仪器、仪表、计算机、医疗器械、轻工等行业广泛使用。该产品主要生产商是美国杜邦公司、英国ICI公司、日本旭硝子和大金公司等世界氟化工行业巨头。当时国内的生产总量仅有8000吨左右，大量依靠进口。聚四氟乙烯这个尖端高科技产品，从某种程度上讲已成为氟化工行业企业综合实力的象征。单体装置做到3000吨，几乎没有人敢想过。但东岳知难而上，在整合国内专家和科研机构力量的基础上，不断克服技术、工艺难题，硬是靠中国人自己的力量用很短的时间建成了全国最大的3000吨PTFE单体装置。中国聚四氟乙烯和氟化工格局因此而发生改变。以后他们又被改扩建至6000吨、12000吨规模，使中国聚四氟乙烯与欧美的差距缩短了20年时间，成为聚四氟乙烯生产强国。万吨四氟乙烯及其聚合物装置经专家鉴定：有四大技术创新点，有六项技术填补国内空白，规模技术达到国际先进水平。
东岳科技创新的另一标志性成果，是其与上海交通大学联合攻关具有重大意义的工业用离子膜项目，攻克了离子膜的核心技术——全氟离子交换树脂。该项目是原化工部排在首位的四大技术难题之一，属世界尖端高技术项目。此项成果被称为“打破了数十年的美国、日本技术垄断，对中国氯碱行业、燃料电池和未来新能源革命做出了里程碑式的贡献”。全氟离子交换膜生产技术的研发成功，对我国氯碱工业和氢燃料电池行业，将发挥不可估量的影响。氯碱工业是化学工业的支柱产业，我国氯碱的总装备能力已达1100万吨/年，位居世界第二。其中数百万吨离子膜烧碱装置所用离子膜仍然完全依赖进口，这对我国经济安全是一个潜在隐患。氢能具有可再生性、零排放等优点，将氢能转化为电能的氢燃料电池，将成为新一代电动汽车的绿色动力。这对于解决城市汽车噪音和尾气污染，对于我国的能源战略，都具有重要意义。东岳公司全氟离子交换膜生产的核心技术及其在氯碱行业和氢燃料电池行业上的应用，对于我国化工行业来说是一个里程碑式的新标志。
在氟化工行业打破了多项国外技术垄断，靠自主知识产权形成了自己的核心竞争力，这在中国企业界是不多见的。据了解，近年来东岳每年的科技投入都占到销售收入的10％左右。目前，他们先后与国内20多家高等院校和科研机构建立了资本和技术合作关系，拥有近百名博士、硕士和专家队伍，并分别在北京和上海成立了东岳清华绿色新技术研发中心、东岳上海交大高分子材料研究所，这就是他们的创新之源。
