二、实行大部门体制要同经济社会发展的现实需求相联系
新阶段实行大部门体制，重要的在于，要同经济发展方式转变、决策与执行分开、中央与地方关系的调整、公共治理结构的改善相联系。例如，从经济发展方式转变对政府职能的要求看，实行大部门体制应当考虑：（1）加强政府中长期战略规划职能。我国整体经济的中长期规划和宏观政策的稳定仍是第一位的。在这个前提下，成立国家专司经济中长期规划和宏观经济政策的经济部或经济发展委员会十分重要。（2）加强国家的能源战略职能。为适应国家能源资源的需求，建立国家能源委员会或能源部，具有一定迫切性。（3）加强国家对外经济战略职能。在我国由开放大国向开放强国转变的过程中，对外战略职能尤为重要。（4）将国有资产管理纳入国家的经济战略职能。（5）强化市场的监管职能和统筹协调。（6）扩大国家环境保护职能。从我国的环境保护对经济发展的影响看，尽快组建国家环境保护部，以适应国家环境保护的需求。
向着明确的方向，稳步推进大部门体制。“着力转变职能、理顺关系、优化结构、提高效能，形成权责一致、分工合理、决策科学、执行顺畅、监督有力的行政管理体制。”这是实行大部门体制的主要目标和总体要求。全面把握这个目标和要求十分重要。只要目标选对了，未来稳步推进大部门体制就会很顺利。我认为，实现大部门体制是一个选准方向、逐步推进的过程。这是因为：第一，大部门体制的实行涉及到很多部门的利益和官员的利益，各种利益关系需要协调。因此，建立大部门体制的过程将具有一定的复杂性。第二，大部门体制的目标是推进政府转型。正是在这个前提下，十七大报告提出了“加大机构整合力度，探索实行职能有机统一的大部门体制，健全部门间协调配合机制。”
三、实行大部门体制需要推进配套改革
实行大部门体制不仅取决于经济体制改革的进程，也取决于社会体制、政治体制、文化体制的改革进程。例如，实行大部门体制涉及到政治体制改革。干部制度改革、中央地方关系调整、行政统一性等等，都涉及到政治体制改革，都需要政治体制改革有实质性推进。
实行大部门体制目的是为了适应政府职能转变、提高决策的效率和决策的科学性。只有把政府决策、执行和监督职能分离开，并相互制约，才能形成良好的权力运行机制。如果没有这些配套改革，大部门体制的实行将会十分困难。目前，政府自身改革最大的问题不是减少机构和精简人员，关键是要围绕推进政府改革的大方向，加强中央政府的决策职能。在这个情况下，决策、执行和监督职能要相对独立。所以，建立大部门体制的体制机制设计一定要合理。
现在有一部分部委，应当是政策决策的最高机构，但却在相当大程度上管钱、管人、管资源的分配，把精力用于执行职能层面；另一方面，某些政策决策权又被相对集中到某些综合部门，从而导致了决策主体和决策责任的缺位。
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