4月1日，新疆和田行署新闻办公室发表消息称，3月23日，极少数“三股势力”分子在和田市大巴扎，企图煽动群众挑起事端，被我公安干警及时制止，并依法处置。和田市大巴扎是和田地区最大的集贸市场，当日中午，有10万群众赶集。极少数“三股势力”分子打着煽动分裂国家的旗帜，在市场内聚集闹事，并企图欺骗煽动群众挑起事端，制造影响。为维护和田社会稳定大局，维护群众正常生产生活秩序，我值勤民警在现场群众的协助下，迅速制止，依法处置。在制止过程中，没有发生伤亡，没有影响集贸市场正常交易秩序。目前，和田社会大局稳定，群众生产生活秩序正常。3月23日，极少数“三股势力”分子在和田市大巴扎，企图煽动群众挑起事端，被我公安干警及时制止，并依法处置。
4月1日，东方航空公司又有3架飞机采用这种方式返航。东方航空公司称，返航是因为天气原因。而有飞行员私下向记者透露，返航是为了向公司争取待遇，也是飞行员对“3·31”集体返航事件的声援。4月2日,在东方航空云南分公司飞行员“3·31”集体返航事件发生后的第三天,东航云南分公司召集所有在昆明的飞行员开会。会后,几乎所有的飞行员全部改口,称他们返航是因为天气原因。3日,所有参与返航事件的飞行员已执行飞行任务。4月4日晚上，民航局进行研究后决定，民航云南监管办封存所有返航航班资料、目的地机场天气实况，以及相关飞行数据。民航局派出的工作组将对返航原因进行详细调查。4月5日，中国民用航空局派出工作组，对东航航班不正常原因进行详细调查。这是民航局首次对东航航班不正常事件作出回应。 这位负责人表示，将坚定不移地维护消费者的合法权益，维护行业的健康发展，确保飞行安全。他强调，如果发现飞行员有故意延误航班等有悖职业道德的行为，将责成有关方面依法依纪对当事人作出严肃处理。６日，东航方面称，东航上海总部已于６日上午派出工作组前往云南分公司调查航班不正常原因。工作组由东航主管安全和生产的副总经理和相关部门的人员组成。民航局也派出两名观察员与工作组一起进行调查。此前，东航郑重声明，如证实确因人为因素故意返航，东航将依法依纪严肃处理。对于此事件给旅客带来的诸多不便，东航表示诚挚的歉意。
