在印染工艺环节所产生的废水，COD 和色度都很高，微生物，例如，酵母菌、真菌、藻类等，可以通过吸附或降解的方式去除废水中的染料。由于废水中存在着各种各样的有机物和无机物，利用微生物氧化、分解、吸附废水中有机物，从而降低废水色度的方法称为废水的生物处理。废水的生物处理实质就是这些物质大部分都可以被微生物作为营养物质而加以利用。将原有的有颜色的复杂高分子有机物转化为几乎无色的简单分子结构的有机物（或无机物）。生物法可分为好氧法和厌氧法两大类；一些细菌只能在有氧存在的废水中生长，称好氧法，另一些细菌只能在无氧的废水中生长，叫厌氧法。微生物染料脱色机理比较复杂，有些过程到目前尚不十分明确。一般认为，偶氮染料的脱色机理是：
偶氮化合物分子结构一种还原酶还原，偶氮双键断裂，产生芳香胺类化合物，接着这种芳香胺类分子在有氧条件下被脱氨，生成酚类化合物，随后酚类分子再被开环，生成脂肪烃（酸）类化合物，最后，脂肪胫（酸）被氧化分解产生无色CO2 和水。由此可见，微生物繁殖快，适应性强而且往往成本更低一些，这些特点使得生化法有着得天独厚的优势。
