在精益生产推进过程中，企业又大量地吸收了来自西方的、同一个思想体系的其它成熟理论和应用方法和精益综合在一起应用，如业务流程再造BPR、价值工程VE、价值流图VSM、6SIGMA、世界级制造、ABC作业成本法和平衡计分法等等。这些独立发展的管理理念作为精益的同盟军，为丰富精益的哲理、方法、工具拓展了巨大的空间。
精益生产的应用实践中，精益自身的理论、方法也有巨大的发展。消除浪费、降低成本，或者消除非增值作业是个宏大而广泛的概念。在推动精益应用过程中，企业广泛采用丰田的行之有效的方法，去实现精益的目标。这些方法如：JIT、JIDOKA、HEIJUNKA、KANZEN、KANBAN、单元生产、单件流、客户同步节拍TakeTime、标准化工作、5S咨询、3P等。有人将它们称为精益工具。
等。有人将它们称为精益工具。
“精益大树”
“精益工具”和“精益同盟军”结合在一起，造就了一棵生长繁茂的“精益大树”。精益大师JimWomack最近使用的“精益管理”这个新词语、以及“扩展精益企业”、“精益企业价值”等新概念使精益思想和方法在新的高度上继续发展和完善。使“精益”这棵大树越加茂盛。
但是，精益理论和工具蓬勃发展的另一面是，传统的出自丰田的精益方法和西方的管理学科交织在一起、名词繁多、多种外来语交错，加之应用过程、企业和人的不同取向和理解，出现了某些概念和做法被混淆。以至精益又好像一棵自由生长的大树，繁茂而难以理清它的脉系。这样增加了对精益原则理解和实现的困惑。
“精益小屋”
精益无论是自身的深化还是它与横向学科的关联和扩展需要建立一个科学的可扩展的精益思想体系——清晰的精益系统框架，有助于帮助企业准确理解和应用这些精益工具。很多学者已经做过精益系统化的研究，如日本著名的门田安弘教授就提出过“丰田生产方式体系”的框架。更清晰的精益生产体系的建立，可以用著名的“精益小屋”为基本框架。“两个支柱”和“两层基础”是精益生产方式第一层面的内容。两个支柱是：准时制（JIT）和自働化（jidoka）。“两层基础”中的第一层是工作方法：“通过PDCA循环法则或5S管理咨询等其它科学方法反复进行的标准化工作和持续改进（kaizen）不断的加以改善和维持。”，精益小屋最底层的基础是生产环境的“稳定性精益工具箱”中的各种方法不是同等的堆砌，精益工具和精益同盟军的所有内容是有层次的系统结合，不能将它们并列起来。实现精益也不能陷入忙碌又盲目的“把玩一系列工具”的境地。这种本末倒置的做法，等事情做完了，“精益”也就终结了。”。从这个层次结构看，实施精益先从打基础开始，没有坚实的基础JIT和自动化都成为空中楼阁。在这个精益小屋中，特地增加了价值流图为入门的阶梯，以强调它在实施精益中的重要性。
